硬核支撐基孔肯雅熱防控!華大智造T1+測序儀破譯病毒全貌
近期,廣東省佛山市等地報告基孔肯雅熱確診病例。面對輸入與本地傳播的雙重挑戰(zhàn),華大智造的基因測序技術為快速病毒溯源提供了關鍵技術支撐,其長短讀長測序平臺在實踐中形成了優(yōu)勢互補的“黃金搭檔”。其自主研發(fā)的短讀長測序儀DNBSEQ-T1+(簡稱“T1+”)和長讀長測序平臺CycloneSEQ G100-ER(簡稱“G100-ER”),分別在疾控實驗室與海關口岸場景中發(fā)揮核心作用,助力實現(xiàn)精準防控。截至目前,近400臺由華大智造提供的全讀長(SEQ ALL)系列測序儀已部署于全國各地疾控和海關系統(tǒng),隨時待命應對突發(fā)公共衛(wèi)生事件。
在病毒剛開始傳播、基因組信息未知的情況下,疾控系統(tǒng)通過“T1+”測序儀完成4例基孔肯雅病毒感染者樣本的全基因組測序,破譯基孔肯雅病毒全貌,覆蓋度均超99.9%,成功區(qū)分東中南非型與亞洲型病毒株。針對1例極低載量樣本,該平臺通過宏轉錄組測序技術仍獲取完整病毒序列,驗證了其在復雜樣本中的高效溯源能力。作為全球首款24小時產(chǎn)出Tb級數(shù)據(jù)的桌面測序儀,“T1+”集成樣本制備與生物信息分析模塊,實現(xiàn)“測序-分析一體化”全閉環(huán)流程,SE50測序最快僅需7小時,大幅提升突發(fā)疫情響應效率。
華大智造測序技術在此輪基孔肯雅熱流行的成功應用并非偶然。早在2024年1月,廣州醫(yī)科大學附屬市八醫(yī)院就曾聯(lián)合華大智造,利用優(yōu)化的宏轉錄組測序策略和MGISEQ-2000測序儀,成功實現(xiàn)了對一例極低載量基孔肯雅輸入病例(旅行史為東帝汶)的高效溯源,獲得了全長基因組并確認了其進化分型。
在海關口岸等一線防控前沿,CycloneSEQ平臺憑借納米孔技術的實時性、便攜性成為關鍵工具。應用CycloneSEQ平臺,如G100-ER測序儀進行基孔肯雅病毒全基因組測序,數(shù)據(jù)顯示僅需20分鐘產(chǎn)生的數(shù)據(jù)即可達到100%的基因組覆蓋度,與傳統(tǒng)高通量測序結果一致。這種“即測即判”能力避免了樣本轉運延遲,助力海關從源頭攔截輸入病例。
基因測序技術也正加速走向更廣泛的應用。2024年全國共有37款基因測序儀獲NMPA批準用于臨床檢測,其中23款基于華大智造DNBSEQ技術,占國內(nèi)總獲證數(shù)量的62%。截至2024年末,華大智造全球基因測序儀累計銷售裝機總數(shù)已超4500臺,占全球新增銷售裝機市場份額約28.2%,較2023年顯著提升9.5個百分點。同時,其業(yè)務布局已從核心的基因測序儀和實驗室自動化,拓展至包括生物樣本庫、細胞組學、時空組學等在內(nèi)的多組學綜合工具。公司還在司法、動物疫病等領域積極拓展,并與法國研究基金會合作推動微生物研究。
臨床、農(nóng)業(yè)、疾控、海關等多場景需求的爆發(fā)與放量,疊加多組學業(yè)務的高速增長和核心測序儀裝機量的持續(xù)攀升,為華大智造未來業(yè)績提供了堅實的驅動力。面對未來,作為全球首個且國內(nèi)唯一同時擁有大規(guī)模商業(yè)量產(chǎn)級短讀長(DNBSEQ)與長讀長(CycloneSEQ)測序產(chǎn)品的企業(yè),華大智造有望依托自主可控的核心技術,在生命科學工具領域持續(xù)擴大市場份額,實現(xiàn)穩(wěn)健的業(yè)績增長,同時持續(xù)為病原微生物監(jiān)測與防控提供多元化、全場景的解決方案,助力筑牢公共衛(wèi)生安全屏障。
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